ریاست دانشگاه بالاترین مقام در دانشگاه است که با پیشنهاد وزیر علوم تحقیقات و فناوری و تصویب شورای عالی انقلاب فرهنگی برای دوره چهار ساله به این مقام منتصب می شود که زمان این دوره در صورت موافقت افزایش می یابد.
تمامی معاونتها ، ادارات و دفاتر دانشگاه زیر نظر ریاست عالی دانشگاه مدیریت می شوند.زیر مجموعه های ریاست دانشگاه عبارت است از: